葱类病虫害主要有霜霉病、锈病、紫斑病以及葱蝇和葱蓟马。
葱类霜霉病
葱类霜霉病是大葱、圆葱的重要病害，除危害大葱和圆葱外，还危害大蒜、韭菜等。霜霉病主要侵害叶和花梗，在黄绿色的病斑上生有一层白色的霉状物，这是病菌的菌丝体和孢子囊。后期病部受其他菌的腐生，产生黑色霉。霜霉病的发生喜欢低温高湿的气候条件，发病的最适温度是15℃，在这样的温度条件下，病菌的潜伏期是5～10天。在春季和初夏，如遇白天温暖，夜晚凉爽，连阴多雨的天气，有利于病害的发生，尤其是连续的重雾天，常会发生霜霉病的大流行。另外，地势低洼，土壤粘重，大水漫灌，过于密植，生长不良的地块发病也重。
防治霜霉病主要采取以下措施：首先，要与非葱蒜类作物实行2～3年的轮作；其次，在不影响生长的前提下，尽量降低田间湿度，增强植株长势，提高抗病力；第三，化学防治。当田间开始发病时，从发病初期开始喷药保护，常用的药剂有：72%杜邦克露可湿性粉剂800倍液、或用64%杀毒矾可湿性粉剂800倍液、或用58%瑞毒霉锰锌可湿性粉剂700倍液、或用70%乙磷铝锰锌可湿性粉剂500倍液。为了提高药液的粘着性，可混加洗衣粉500倍液。喷药应每隔7～10天一次，连喷3～4次；如遇雨天，要缩短喷药时间。
当霜霉病流行的季节，如遇大雾天气，病害的发生格外严重，而在雾散后马上喷一遍清水，可起到防病作用。
葱类锈病
葱类锈病主要危害大葱和圆葱，也危害大蒜和韭菜。
这种病在病叶上生出的一些黄色小点是锈病病菌的夏孢子堆，里面的橙黄色粉末是它的夏孢子。在后期，病部又长出一些黑褐色的小点是病菌的冬孢子堆，里面包着成千上万的冬孢子。
锈病的发生喜欢低温高湿的气候条件，孢子萌发的最适温度是9～18℃，潜伏期是10天。当气温在24℃以上时，发病受到影响。因而春、秋两季连阴多雨、气温较低时，发病严重。
如果冬季温暖多湿，有利于孢子的越冬，来年春季锈病严重；在夏季，如果低温多雨，则秋季发病严重。田地肥力不足，植株生长不良也是发病严重的一个因素。
防治锈病，首先要提高土壤肥力。多施磷钾肥，增强植株的抗病能力；第二，发病重的田块，应提前收获，并避免在附近种植葱蒜类蔬菜；第三，在发病初期应及时喷药防治，使用的药剂有：25%菌通散（三唑酮）乳油800倍液、或用12.5%禾果利（烯唑醇）可湿性粉剂1500倍液。每隔10天喷药一次，连续喷2～3次。
葱类紫斑病
葱类紫斑病在大葱上主要侵害叶子和花梗，在圆葱上还可侵害鳞茎，导致软腐、皱缩。除葱类外还可危害大蒜。
防治葱类紫斑病，在田间管理上，应注意的问题与以上两种病害相同，但防治所使用的药剂不同。在苗期和田间初发病时可使用1.5%多抗霉素可湿性粉剂300倍液、或用70%甲基托布津可湿性粉剂700倍液、或用75%百菌清可湿性粉剂600倍液、或用70%代森锰锌可湿性粉剂700倍液、或用80%大生可湿性粉剂800倍液等。重病田每隔7～10天喷药一次，连续喷2～3次。
葱蝇
葱蝇又叫葱蛆，是一种寡食性害虫，只危害百合科蔬菜，尤其是葱和蒜。
防治葱蝇应采取农业防治和化学防治相结合的方法。在大蒜烂母子的时候，可以随浇水追施一遍碳氨，能显著减轻危害。当田间发现地蛆后，应勤浇水，必要时可大水漫灌。
化学防治应地上和地下防治相结合，成虫以地上防治为主。在成虫发生初期，可使用80%敌敌畏乳油800倍液、4.5%高效氯氰菊酯乳油1500倍液、2.5%敌杀死乳油2000倍液、2.5%攻击菊酯乳油1500倍液，喷施土表、根茎和茎部，间隔7～8天喷一次，连喷两次。
除在田中喷药外，还应防治在田边蜜源植物上的成虫。在田中发生幼虫后，可使用药液灌根，使用的药剂有：50%辛硫磷乳油1000倍液、80%敌敌畏乳油800倍液等。灌根时，要使药液至少渗入地下5厘米处，在可能的情况下，施药量越大，效果越好。
葱蓟马
葱蓟是一种寄主广泛的害虫。防治葱蓟马，首先应收拾干净残枝败叶，消灭虫源。其次，要勤浇水消灭地下的若虫和蛹。第三，田间蓟马发生后，进行喷药防治，可使用20%百福灵3000倍液、25%吡虫啉3000倍液等。喷药应在清晨露水未干时进行，防止成虫逃逸。
大蒜的病虫害主要有叶枯病、灰霉病以及蚜虫、根蛆等。
叶枯病
该病为真菌性病害，病菌主要在病残体上越冬。多雨高温、氮肥过多、过于繁茂的徒长弱苗极易发病。病菌侵染叶片和花梗，一般多从叶尖开始发病，逐渐向下扩展。初生为白色圆形斑点。后扩大为密生黑色粉状霉层，最后叶和梗变黄枯死，并从病部折断。发病严重时，大蒜不易抽薹。防治方法：一是加强田间管理，提高植株的抗病性；二是收获后清除病残体并集中处理；三是喷施50%扑海因可湿性粉剂1000倍液、或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液、或80%大生800倍液、或70%托布津500倍液、或25%嘉润2000～3000倍液。
灰霉病
该病为真菌性病害，主要危害叶片，多发生于植株生长中后期，病斑初为水渍状，后为白色或灰褐色，病斑扩大以后成梭形或椭圆形的灰白色大斑，半叶甚至全叶表面生灰褐色绒毛状霉层，组织干枯，易拔起。病菌以菌丝态在土壤或病残体上越冬。大蒜感染此病后，常造成叶柄和地下蒜头腐烂。防治方法：一是加强田间管理，合理密植，雨后及时扫除渍水；二是增施磷钾肥，提高植株抗病能力；三是在发病初期，喷施50%速克灵可湿性粉剂1000～1500倍液，或50%扑海因可湿性粉剂1000倍液。
大蒜虫害
常见的害虫有蚜虫、根蛆、葱蓟马、螨等。防治方法是施用充分腐熟的有机肥作基肥，且蒜种与肥料应适当隔开，切不可将蒜种贴在肥料上种植。对于根蛆危害严重的地方，可用9晶体敌百虫1000倍液，或40%毒死蜱1500倍液灌根。如发生葱蓟马、蚜虫，可用20%百福灵3000涪液喷雾防治。如发生螨虫，可用73%炔螨特3000倍液喷雾防治。
